W związku ze śmiercią Ojca Świętego Jana Pawła II Prezydent Torunia Michał Zaleski skierował list kondolencyjny do Nuncjusza Apostolskiego w Polsce arcybiskupa Józefa Kowalczyka.
Ksiądz Arcybiskup
Józef KOWALCZYK
Nuncjusz Apostolski w Polsce
Ekscelencjo, Księże Arcybiskupie.
Przekazuję Księdzu Arcybiskupowi wyrazy serdecznego współczucia w związku ze śmiercią Ojca Świętego Jana Pawła II. Toruń wraz z całą Polską i światem pogrążył się w żałobie po odejściu do wieczności ukochanego Pasterza. W tych bolesnych dniach mieszkańcy Torunia łączą się w żalu z wszystkimi, dla których zmarły Papież był najbliższym Ojcem, dobrym i świętym człowiekiem, najwyższym autorytetem moralnym i wzorem do naśladowania.
W serdecznej pamięci pragniemy zachować w Toruniu całe dziedzictwo duchowe i nauczanie Jana Pawła II, w tym liczne i drogie dla torunian związki Ojca Świętego z naszym miastem. Za wielki dar uznajemy zwłaszcza apostolskie wizyty Jana Pawła II w Ojczyźnie, powołanie Diecezji Toruńskiej, nawiedzenie Torunia w dniu 7 czerwca 1999 r., a także przyjęcie tytułów Honorowego Obywatela Torunia i doktora honoris causa Uniwersytetu Mikołaja Kopernika.