Tysiące zniczy zapłonęło w Toruniu 2 kwietnia 2008 r., w trzecią rocznicę śmierci Jana Pawła II. Mieszkańcy wspominali Ojca św. w katedrze, w miejscach które odwiedził podczas pielgrzymki w 1999 r. i pod jego pomnikiem przy Centrum Sztuki Współczesnej.
Główne obchody rocznicowe odbyły się w toruńskiej katedrze śś. Janów. Tam 1 kwietnia została otwarta wystawa poświęcona Janowi Pawłowi II, zatytułowana "Wstańcie, chodźmy". Prezentuje ona prace profesorów i absolwentów UMK w Toruniu, twórców znanych i zasłużonych oraz młodych, dopiero zaczynających swoją działalność artystyczną, którzy w swoich pracach przedstawiają impresje na temat swojego spotkania z Ojcem Świętym i głoszoną przez niego nauką.
W rocznicę śmierci Jana Pawła II, 2 kwietnia o godz. 18.00 w katedrze śś. Janów została odprawiona Msza św. w intencji beatyfikacji Papieża. Po mszy rzesze wiernych, w asyście orkiestry wojskowej, wyruszyły z kościoła pod pomnik papieski przy alei Jana Pawła II. Tam przez cały dzień torunianie przynosili kwiaty oraz zapalali znicze, których do wieczora płonęły już setki.
Pod pomnikiem Honorowego Obywatela Torunia uczestnicy mszy wspólnie odśpiewali ulubioną pieśń Ojca Św. "Barkę", a przedstawiciele lokalnego samorządu: marszałek Piotr Całbecki, prezydent Michał Zaleski i przewodniczący Rady Miasta Waldemar Przybyszewski złożyli kwiaty. Okolicznościowe wiązanki złożyli też reprezentanci toruńskich szkół noszących imię Jana Pawła II (V LO i SP nr 13) oraz harcerze.
Tradycyjnie do rocznicowych obchodów włączyli się także studenci. O godz. 21.15 Niezależne Stowarzyszenie Studentów zorganizowało czuwanie przed Aulą UMK. Zgromadziło ono setki młodych ludzi. Odmówiono różaniec oraz odśpiewano pieśni żałobne.